隨著微波技術在各個領域的滲透與應用，這一技術也越來越廣泛的應用于藥品生產中的干燥滅菌工藝過程。由于中藥丸劑產品具有體積小、有效成分高度集中、服用方便等特點，因此具有廣泛的發展空間及較大的市場占有額。微波干澡是指利用頻率為915-2450MH的微波能量使物料本身發熱升溫、蒸發水分進行干燥的方法。微波干爆不同于傳統干爆方式，其熱傳導方向與水分擴散方向相同，與傳統干燥方式相比，具有干燥速率大、節能、生產效率高、干燥均勻、清潔生產、易實現自動化控制和提高產品質量等優點，因而在于燥的各個領域越來越受到重視。

微波干燥在中藥丸劑生產中的控制水蜜丸中藥采取微波干燥時一般應將物料溫度控制在65~95°C范用內,而出料溫度控制在75~105范內物料在傳輸時應保持0.8~1.6m/m的傳遞速度,為了避免出現裂,要采取兩到三次例波:水丸中藥采取微波干燥時，一般物料溫度控制在50~95C范圍內而出料溫度控制在60~105°C范圍內,物料傳輸時應保持0.8~1.6mm的傳遞速度為避免出現裂丸,通常要采取四到六次的微波。

水分主要受濕藥丸在攤鋪時的厚度影響以及微波干燥過程中的溫度影響。其次物料在傳輸過程中的運輸速度也有對水分指標產生一定程度的影響。水分指標不能過高，通常水蜜丸藥應將水分控制在9%以下，而水丸藥則應控制在5% ~7%之間。外觀外觀主要受濕藥丸水分大小以及攤鋪厚度影響。物料在傳輸過程中的速度也對為藥外觀產生一定影響。丸藥制造中應將烈丸藥比率按制在3%以下，不完整丸比率控制在2%以下。為了避免產生裂丸及不整丸，應在生產時控制好濕丸的含水率，最好控制在14%以內。中藥丸劑中包含的水分能夠吸收大量的微波，在高速旋轉的微波電場中由于摩擦生熱進而起到干燥作用。

微波干燥是由內部產生熱量，因此丸劑整體均勻受熱，并發生膨脹，干燥后不容易發生變形，且丸劑表面色澤均勻、圓整，此外，微波電場環境中也使得微生物體內水分子吸收微波，溫度升高，從而起到殺菌效果。經過微波殺菌后，丸劑藥中的細菌數量較原生藥含量下降1-2個級別。通常微波時間越長殺菌效果越明顯。采用微波烘干設備耗能量很小，大大提高了能源利用率。